Модель формирования α-спирали белка на основе двухчастичной модели движения в потенциале Леннарда-Джонса

Рассматривается процесс образования белковой структуры, состоящей из нерегулярной части и регулярной спирализованной вторичной структуры (правозакрученной α-спирали) как последовательного перестроения линейной цепочки аминокислотных остатков, образующей первичную структуру на рибосомах, в процессе последующей укладки полипептидной цепи в правозакрученную α-спираль. Мономеры белковой структуры – аминокислотные остатки – в модели представлены в виде шаров, положения центров которых определяются координатами атомов α-углеродов. Уравнения движения остатков основаны на двухчастичной модели движения в потенциале Леннарда-Джонса и на данных о пространственном расположении атомов углерода в α-спирали.